As an example we will use measurements of penguins made at Palmer Station, Antarctica.
Since the measurements are in different units, we supply an appropriate scaling.
library(langevitour)
library(palmerpenguins)
completePenguins <- na.omit(penguins[,c(1,3,4,5,6)])
completePenguins
#> species bill_length_mm bill_depth_mm flipper_length_mm body_mass_g
#> 1 Adelie 39.1 18.7 181 3750
#> 2 Adelie 39.5 17.4 186 3800
#> 3 Adelie 40.3 18.0 195 3250
#> 5 Adelie 36.7 19.3 193 3450
#> 6 Adelie 39.3 20.6 190 3650
#> 7 Adelie 38.9 17.8 181 3625
#> 8 Adelie 39.2 19.6 195 4675
#> 9 Adelie 34.1 18.1 193 3475
#> 10 Adelie 42.0 20.2 190 4250
#> 11 Adelie 37.8 17.1 186 3300
#> 12 Adelie 37.8 17.3 180 3700
#> 13 Adelie 41.1 17.6 182 3200
#> 14 Adelie 38.6 21.2 191 3800
#> 15 Adelie 34.6 21.1 198 4400
#> 16 Adelie 36.6 17.8 185 3700
#> 17 Adelie 38.7 19.0 195 3450
#> 18 Adelie 42.5 20.7 197 4500
#> 19 Adelie 34.4 18.4 184 3325
#> 20 Adelie 46.0 21.5 194 4200
#> 21 Adelie 37.8 18.3 174 3400
#> 22 Adelie 37.7 18.7 180 3600
#> 23 Adelie 35.9 19.2 189 3800
#> 24 Adelie 38.2 18.1 185 3950
#> 25 Adelie 38.8 17.2 180 3800
#> 26 Adelie 35.3 18.9 187 3800
#> 27 Adelie 40.6 18.6 183 3550
#> 28 Adelie 40.5 17.9 187 3200
#> 29 Adelie 37.9 18.6 172 3150
#> 30 Adelie 40.5 18.9 180 3950
#> 31 Adelie 39.5 16.7 178 3250
#> 32 Adelie 37.2 18.1 178 3900
#> 33 Adelie 39.5 17.8 188 3300
#> 34 Adelie 40.9 18.9 184 3900
#> 35 Adelie 36.4 17.0 195 3325
#> 36 Adelie 39.2 21.1 196 4150
#> 37 Adelie 38.8 20.0 190 3950
#> 38 Adelie 42.2 18.5 180 3550
#> 39 Adelie 37.6 19.3 181 3300
#> 40 Adelie 39.8 19.1 184 4650
#> 41 Adelie 36.5 18.0 182 3150
#> 42 Adelie 40.8 18.4 195 3900
#> 43 Adelie 36.0 18.5 186 3100
#> 44 Adelie 44.1 19.7 196 4400
#> 45 Adelie 37.0 16.9 185 3000
#> 46 Adelie 39.6 18.8 190 4600
#> 47 Adelie 41.1 19.0 182 3425
#> 48 Adelie 37.5 18.9 179 2975
#> 49 Adelie 36.0 17.9 190 3450
#> 50 Adelie 42.3 21.2 191 4150
#> 51 Adelie 39.6 17.7 186 3500
#> 52 Adelie 40.1 18.9 188 4300
#> 53 Adelie 35.0 17.9 190 3450
#> 54 Adelie 42.0 19.5 200 4050
#> 55 Adelie 34.5 18.1 187 2900
#> 56 Adelie 41.4 18.6 191 3700
#> 57 Adelie 39.0 17.5 186 3550
#> 58 Adelie 40.6 18.8 193 3800
#> 59 Adelie 36.5 16.6 181 2850
#> 60 Adelie 37.6 19.1 194 3750
#> 61 Adelie 35.7 16.9 185 3150
#> 62 Adelie 41.3 21.1 195 4400
#> 63 Adelie 37.6 17.0 185 3600
#> 64 Adelie 41.1 18.2 192 4050
#> 65 Adelie 36.4 17.1 184 2850
#> 66 Adelie 41.6 18.0 192 3950
#> 67 Adelie 35.5 16.2 195 3350
#> 68 Adelie 41.1 19.1 188 4100
#> 69 Adelie 35.9 16.6 190 3050
#> 70 Adelie 41.8 19.4 198 4450
#> 71 Adelie 33.5 19.0 190 3600
#> 72 Adelie 39.7 18.4 190 3900
#> 73 Adelie 39.6 17.2 196 3550
#> 74 Adelie 45.8 18.9 197 4150
#> 75 Adelie 35.5 17.5 190 3700
#> 76 Adelie 42.8 18.5 195 4250
#> 77 Adelie 40.9 16.8 191 3700
#> 78 Adelie 37.2 19.4 184 3900
#> 79 Adelie 36.2 16.1 187 3550
#> 80 Adelie 42.1 19.1 195 4000
#> 81 Adelie 34.6 17.2 189 3200
#> 82 Adelie 42.9 17.6 196 4700
#> 83 Adelie 36.7 18.8 187 3800
#> 84 Adelie 35.1 19.4 193 4200
#> 85 Adelie 37.3 17.8 191 3350
#> 86 Adelie 41.3 20.3 194 3550
#> 87 Adelie 36.3 19.5 190 3800
#> 88 Adelie 36.9 18.6 189 3500
#> 89 Adelie 38.3 19.2 189 3950
#> 90 Adelie 38.9 18.8 190 3600
#> 91 Adelie 35.7 18.0 202 3550
#> 92 Adelie 41.1 18.1 205 4300
#> 93 Adelie 34.0 17.1 185 3400
#> 94 Adelie 39.6 18.1 186 4450
#> 95 Adelie 36.2 17.3 187 3300
#> 96 Adelie 40.8 18.9 208 4300
#> 97 Adelie 38.1 18.6 190 3700
#> 98 Adelie 40.3 18.5 196 4350
#> 99 Adelie 33.1 16.1 178 2900
#> 100 Adelie 43.2 18.5 192 4100
#> 101 Adelie 35.0 17.9 192 3725
#> 102 Adelie 41.0 20.0 203 4725
#> 103 Adelie 37.7 16.0 183 3075
#> 104 Adelie 37.8 20.0 190 4250
#> 105 Adelie 37.9 18.6 193 2925
#> 106 Adelie 39.7 18.9 184 3550
#> 107 Adelie 38.6 17.2 199 3750
#> 108 Adelie 38.2 20.0 190 3900
#> 109 Adelie 38.1 17.0 181 3175
#> 110 Adelie 43.2 19.0 197 4775
#> 111 Adelie 38.1 16.5 198 3825
#> 112 Adelie 45.6 20.3 191 4600
#> 113 Adelie 39.7 17.7 193 3200
#> 114 Adelie 42.2 19.5 197 4275
#> 115 Adelie 39.6 20.7 191 3900
#> 116 Adelie 42.7 18.3 196 4075
#> 117 Adelie 38.6 17.0 188 2900
#> 118 Adelie 37.3 20.5 199 3775
#> 119 Adelie 35.7 17.0 189 3350
#> 120 Adelie 41.1 18.6 189 3325
#> 121 Adelie 36.2 17.2 187 3150
#> 122 Adelie 37.7 19.8 198 3500
#> 123 Adelie 40.2 17.0 176 3450
#> 124 Adelie 41.4 18.5 202 3875
#> 125 Adelie 35.2 15.9 186 3050
#> 126 Adelie 40.6 19.0 199 4000
#> 127 Adelie 38.8 17.6 191 3275
#> 128 Adelie 41.5 18.3 195 4300
#> 129 Adelie 39.0 17.1 191 3050
#> 130 Adelie 44.1 18.0 210 4000
#> 131 Adelie 38.5 17.9 190 3325
#> 132 Adelie 43.1 19.2 197 3500
#> 133 Adelie 36.8 18.5 193 3500
#> 134 Adelie 37.5 18.5 199 4475
#> 135 Adelie 38.1 17.6 187 3425
#> 136 Adelie 41.1 17.5 190 3900
#> 137 Adelie 35.6 17.5 191 3175
#> 138 Adelie 40.2 20.1 200 3975
#> 139 Adelie 37.0 16.5 185 3400
#> 140 Adelie 39.7 17.9 193 4250
#> 141 Adelie 40.2 17.1 193 3400
#> 142 Adelie 40.6 17.2 187 3475
#> 143 Adelie 32.1 15.5 188 3050
#> 144 Adelie 40.7 17.0 190 3725
#> 145 Adelie 37.3 16.8 192 3000
#> 146 Adelie 39.0 18.7 185 3650
#> 147 Adelie 39.2 18.6 190 4250
#> 148 Adelie 36.6 18.4 184 3475
#> 149 Adelie 36.0 17.8 195 3450
#> 150 Adelie 37.8 18.1 193 3750
#> 151 Adelie 36.0 17.1 187 3700
#> 152 Adelie 41.5 18.5 201 4000
#> 153 Gentoo 46.1 13.2 211 4500
#> 154 Gentoo 50.0 16.3 230 5700
#> 155 Gentoo 48.7 14.1 210 4450
#> 156 Gentoo 50.0 15.2 218 5700
#> 157 Gentoo 47.6 14.5 215 5400
#> 158 Gentoo 46.5 13.5 210 4550
#> 159 Gentoo 45.4 14.6 211 4800
#> 160 Gentoo 46.7 15.3 219 5200
#> 161 Gentoo 43.3 13.4 209 4400
#> 162 Gentoo 46.8 15.4 215 5150
#> 163 Gentoo 40.9 13.7 214 4650
#> 164 Gentoo 49.0 16.1 216 5550
#> 165 Gentoo 45.5 13.7 214 4650
#> 166 Gentoo 48.4 14.6 213 5850
#> 167 Gentoo 45.8 14.6 210 4200
#> 168 Gentoo 49.3 15.7 217 5850
#> 169 Gentoo 42.0 13.5 210 4150
#> 170 Gentoo 49.2 15.2 221 6300
#> 171 Gentoo 46.2 14.5 209 4800
#> 172 Gentoo 48.7 15.1 222 5350
#> 173 Gentoo 50.2 14.3 218 5700
#> 174 Gentoo 45.1 14.5 215 5000
#> 175 Gentoo 46.5 14.5 213 4400
#> 176 Gentoo 46.3 15.8 215 5050
#> 177 Gentoo 42.9 13.1 215 5000
#> 178 Gentoo 46.1 15.1 215 5100
#> 179 Gentoo 44.5 14.3 216 4100
#> 180 Gentoo 47.8 15.0 215 5650
#> 181 Gentoo 48.2 14.3 210 4600
#> 182 Gentoo 50.0 15.3 220 5550
#> 183 Gentoo 47.3 15.3 222 5250
#> 184 Gentoo 42.8 14.2 209 4700
#> 185 Gentoo 45.1 14.5 207 5050
#> 186 Gentoo 59.6 17.0 230 6050
#> 187 Gentoo 49.1 14.8 220 5150
#> 188 Gentoo 48.4 16.3 220 5400
#> 189 Gentoo 42.6 13.7 213 4950
#> 190 Gentoo 44.4 17.3 219 5250
#> 191 Gentoo 44.0 13.6 208 4350
#> 192 Gentoo 48.7 15.7 208 5350
#> 193 Gentoo 42.7 13.7 208 3950
#> 194 Gentoo 49.6 16.0 225 5700
#> 195 Gentoo 45.3 13.7 210 4300
#> 196 Gentoo 49.6 15.0 216 4750
#> 197 Gentoo 50.5 15.9 222 5550
#> 198 Gentoo 43.6 13.9 217 4900
#> 199 Gentoo 45.5 13.9 210 4200
#> 200 Gentoo 50.5 15.9 225 5400
#> 201 Gentoo 44.9 13.3 213 5100
#> 202 Gentoo 45.2 15.8 215 5300
#> 203 Gentoo 46.6 14.2 210 4850
#> 204 Gentoo 48.5 14.1 220 5300
#> 205 Gentoo 45.1 14.4 210 4400
#> 206 Gentoo 50.1 15.0 225 5000
#> 207 Gentoo 46.5 14.4 217 4900
#> 208 Gentoo 45.0 15.4 220 5050
#> 209 Gentoo 43.8 13.9 208 4300
#> 210 Gentoo 45.5 15.0 220 5000
#> 211 Gentoo 43.2 14.5 208 4450
#> 212 Gentoo 50.4 15.3 224 5550
#> 213 Gentoo 45.3 13.8 208 4200
#> 214 Gentoo 46.2 14.9 221 5300
#> 215 Gentoo 45.7 13.9 214 4400
#> 216 Gentoo 54.3 15.7 231 5650
#> 217 Gentoo 45.8 14.2 219 4700
#> 218 Gentoo 49.8 16.8 230 5700
#> 219 Gentoo 46.2 14.4 214 4650
#> 220 Gentoo 49.5 16.2 229 5800
#> 221 Gentoo 43.5 14.2 220 4700
#> 222 Gentoo 50.7 15.0 223 5550
#> 223 Gentoo 47.7 15.0 216 4750
#> 224 Gentoo 46.4 15.6 221 5000
#> 225 Gentoo 48.2 15.6 221 5100
#> 226 Gentoo 46.5 14.8 217 5200
#> 227 Gentoo 46.4 15.0 216 4700
#> 228 Gentoo 48.6 16.0 230 5800
#> 229 Gentoo 47.5 14.2 209 4600
#> 230 Gentoo 51.1 16.3 220 6000
#> 231 Gentoo 45.2 13.8 215 4750
#> 232 Gentoo 45.2 16.4 223 5950
#> 233 Gentoo 49.1 14.5 212 4625
#> 234 Gentoo 52.5 15.6 221 5450
#> 235 Gentoo 47.4 14.6 212 4725
#> 236 Gentoo 50.0 15.9 224 5350
#> 237 Gentoo 44.9 13.8 212 4750
#> 238 Gentoo 50.8 17.3 228 5600
#> 239 Gentoo 43.4 14.4 218 4600
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#> 253 Gentoo 48.5 15.0 219 4850
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#> 258 Gentoo 46.8 16.1 215 5500
#> 259 Gentoo 41.7 14.7 210 4700
#> 260 Gentoo 53.4 15.8 219 5500
#> 261 Gentoo 43.3 14.0 208 4575
#> 262 Gentoo 48.1 15.1 209 5500
#> 263 Gentoo 50.5 15.2 216 5000
#> 264 Gentoo 49.8 15.9 229 5950
#> 265 Gentoo 43.5 15.2 213 4650
#> 266 Gentoo 51.5 16.3 230 5500
#> 267 Gentoo 46.2 14.1 217 4375
#> 268 Gentoo 55.1 16.0 230 5850
#> 269 Gentoo 44.5 15.7 217 4875
#> 270 Gentoo 48.8 16.2 222 6000
#> 271 Gentoo 47.2 13.7 214 4925
#> 273 Gentoo 46.8 14.3 215 4850
#> 274 Gentoo 50.4 15.7 222 5750
#> 275 Gentoo 45.2 14.8 212 5200
#> 276 Gentoo 49.9 16.1 213 5400
#> 277 Chinstrap 46.5 17.9 192 3500
#> 278 Chinstrap 50.0 19.5 196 3900
#> 279 Chinstrap 51.3 19.2 193 3650
#> 280 Chinstrap 45.4 18.7 188 3525
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scale <- apply(completePenguins[,-1], 2, sd)*4
langevitour(
completePenguins[,-1], completePenguins$species,
scale=scale, pointSize=2, elementId="myWidget")Things to try:
Some further examples have been omitted from the CRAN package due to their large size and problematic dependencies. They can be viewed on the langevitour website: